Средство «Аквасепт-гель» обладает антимикробной активностью в отношении грамположительных (кроме микробактерий туберкулеза)  и грамотрицательных бактерий (включая возбудителей внутрибольничных инфекций, кишечных инфекций), вирусов (включая аденовирусы, вирусы гриппа, парагриппа, птичьего, свиного гриппа и другие типы вируса гриппа, возбудители острых респираторных инфекций, энтеровирусы, ротавирусы, вирус полиомиелита, вирусы энтеральных, парентеральных гепатитов, герпеса, атипичной пневмонии, ВИЧ-инфекции и др.), грибов рода Кандида и Трихофитон. Пролонгированное антимикробное действие в течение 1 часа.